上海交通大學醫學院附屬仁濟醫院腫瘤學科是上海市臨床重點專科、上海市“重中之重”臨床醫學中心、上海市教委腫瘤學重點學科。《2018年度中國醫院科技量值評價（腫瘤學）》，綜合性醫院中列第5位。已建立12個腫瘤MDT，在全國率先成立MDT專家委員會，完善集腫瘤預防、診斷、治療及康復一體化服務平臺，構建精準的腫瘤全程管理體系，其中泌尿、消化、婦科腫瘤為優勢學科。建立了上海最大的腫瘤日間化療中心。積極牽頭和參與國際性多中心腫瘤新藥研究、開展腫瘤新技術臨床應用，主持或參與制定多項臨床指南或共識，推動腫瘤規范化和個體化診療；建立國內首個呼吸活檢實驗室，探索肺癌患者更便捷、準確的早篩早診模式；國內首次通過“一人一批”獲得海外抗癌新藥治療，成為國外已上市抗腫瘤新藥的國內首個試點單位；建立腫瘤專科聯盟，實現一體化、同質化管理。 

 腫瘤學科現為上海交通大學醫學院腫瘤專科醫師培訓專家組組長單位、上海市腫瘤內科專科規培基地。現著手建設上海交通大學醫學院臨床腫瘤學系，建立了國內第一個以大學為單位，跨醫院、跨學科腫瘤專科培訓平臺。此外，腫瘤相關的國家自然科學基金項目位居上海市綜合醫院第一，并發表多篇高水平研究論文。